Согиницы находились на важном торговом пути, связывавшем Великий Новгород с Белым морем и Архангельскими землями. В регионе проживали финно-угорские народы (вепсы, людиковцы, карелы), а также новгородские и московские торговцы. В XIV веке территория вошла в состав Обонежской пятины Новгородской земли, а в 1649 году стала частью Олонецкого уезда.

Развитие церковного строительства в этих местах определялось влиянием новгородской архитектурной традиции. Воскресенский погост на реке Важене упоминается с 1230 года. В XVI веке здесь уже существовала Воскресенская церковь. Первые сведения о Согиницах встречаются в Писцовой книге 1563 года, где деревня названа «Согиничи». Однако в начале XVII века шведские, польские и литовские войска разорили эти земли, и упоминания о деревне временно исчезли из архивов.

Церковь святителя Николая была возведена во второй половине XVII века, после восстановления деревни. Возможно, она создавалась по образцу более ранних церквей Воскресенского погоста, отражая черты прионежского деревянного зодчества. Основными характеристиками этой школы являются ярусное построение, компоновка типа «восьмерик на четверике», шатровое завершение и богатый резной декор. Аналогичные храмы строились в соседних районах Олонецкой губернии, включая Спасо-Преображенскую церковь в Усть-Пидьме и Покровскую церковь на острове Кижи.